विज्ञान की नई सीमाओं का अन्वेषण करना तथा मानव संसाधनों का विकास करना, ताकि प्रौद्योगिकी विकास और नीति मार्गदर्शन में नेतृत्व प्रदान किया जा सके और एक सशक्त एवं लचीली कृषि प्रणाली को बढ़ावा मिले, जो उत्पादक, पर्यावरण–अनुकूल, सतत, आर्थिक रूप से लाभकारी तथा सामाजिक रूप से न्यायसंगत हो। इस मिशन की प्राप्ति हेतु संस्थान ने निम्नलिखित दायित्व अपनाए हैं:
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उत्पादकता एवं गुणवत्ता में वृद्धि हेतु क्षेत्रीय एवं उद्यानिकी फसलों पर मौलिक, रणनीतिक तथा अग्रिम (पूर्वानुमानात्मक) अनुसंधान।
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सतत कृषि उत्पादन प्रणाली के लिए संसाधन–उपयोग दक्ष एकीकृत फसल प्रबंधन प्रौद्योगिकियों के विकास हेतु अग्रणी क्षेत्रों में अनुसंधान।
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कृषि विज्ञान के क्षेत्र में स्नातकोत्तर शिक्षा एवं मानव संसाधन विकास के माध्यम से शैक्षणिक उत्कृष्टता के केंद्र के रूप में कार्य करना।
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नवीन अवधारणाओं एवं दृष्टिकोणों का विकास कर तथा गुणवत्ता एवं मानकों के लिए राष्ट्रीय संदर्भ बिंदु के रूप में कार्य करते हुए कृषि अनुसंधान, शिक्षा, विस्तार, प्रौद्योगिकी मूल्यांकन एवं हस्तांतरण में राष्ट्रीय नेतृत्व प्रदान करना।
