इसके चार विभाग हैं। प्लांट पैथोलॉजी, एंटोमोलॉजी, नेमाटोलॉजी और कृषि रसायन। नए कीटों और बीमारियों की पहचान करने के लिए स्कूल के छात्रों को कौशल सेट के साथ प्रशिक्षित किया जाता है; महामारी विज्ञान के अध्ययन और प्रारंभिक पूर्व-चेतावनी के लिए निर्णय समर्थन प्रणाली विकसित करना; मेजबान प्रतिरोध की पहचान; जैव रासायनिक और आणविक मेजबान रोगज़नक़ बातचीत; फसली पौधों में कीट और रोग प्रबंधन के लिए उपयोगी जीनों की क्लोनिंग और जेनेटिक इंजीनियरिंग; रोगज़नक़ और कीट लक्षण वर्णन; प्रजातियों/पैथोटाइप्स/उपभेदों की पहचान; सीरोलॉजिकल और आणविक आधारित निदान; एकीकृत कीट प्रबंधन रणनीतियों, पौधों (वनस्पति) उत्पादों का उपयोग, रसायनों के विवेकपूर्ण उपयोग आदि जैसे जैव-नियंत्रण विधियों का विकास करना। जीनोमिक्स, बेहतर निदान और बायोसिस्टमेटिक्स आगामी क्षेत्र हैं जिन पर ध्यान दिया जा रहा है। कृषि रसायनों के विकास, सूत्रीकरण और सुरक्षा पहलू के विविध डोमेन में राष्ट्रीय महत्व के बुनियादी और अनुप्रयुक्त अनुसंधान की योजना और निष्पादन में कृषि रसायनों का संभाग एक प्रवृत्ति निर्धारक साबित हुआ है। पहले स्वदेशी रूप से तैयार और औद्योगिक रूप से अनुकूलित नीम कोटेड यूरिया उर्वरक उद्योग में इसके प्रमुख योगदानों में से एक है।

नए नाशकजीवों और रोगों की पहचान करना, उनका प्रसार और लक्षित नाशकजीवों के साथ-साथ नाशकजीव प्रकोप की भविष्यवाणी पर प्राथमिकता अनुसंधान करना; कीटों के प्रतिरोध और उग्रता के तंत्र के संदर्भ में होस्ट पैरा होस्ट-पैथोजेन इंटरैक्शन के जैव रासायनिक और आणविक आधार, उपयोगी जीनों की क्लोनिंग और फसल पौधों में कीट और रोग प्रतिरोध के लिए आनुवंशिक इंजीनियरिंग; तेजी से और प्रामाणिक पहचान के लिए कीटों, रोगजनक उपभेदों/प्रजातियों/जैव-प्रकारों का जैव रासायनिक और आणविक लक्षण वर्णन; जैव-नियंत्रण विधियों का विकास एकीकृत कीट प्रबंधन रणनीति, पौधों (वानस्पतिक) उत्पादों का उपयोग, रसायनों का विवेकपूर्ण उपयोग, जैव-एजेंटों की कार्रवाई का तंत्र और कीटों और रोगों के प्रबंधन के लिए अन्य पर्यावरण-अनुकूल दृष्टिकोण; आर्टेमेसिया एसपीपी, ऑसिमम सैंक्टम, और अज़ादिराचता इंडिका के साथ-साथ ऑर्गनोफॉस्फेट, पाइरेथ्रोइड्स और जैव-कीटनाशकों के योगों से कृषि-रसायनों का विकास; चयनित नेमाटोड, कीड़ों और सूक्ष्मजीवों के लिए कंप्यूटर आधारित टैक्सोनॉमी, होस्ट रेंज भौगोलिक वितरण और फाइटोसैनिटरी जोखिम विकसित करना; राष्ट्रीय सूत्रकृमि/कीट/सूक्ष्म जीवों/कवक/संग्रह का संवर्धन और अनुरक्षण, उनका जैव-व्यवस्थित लक्षण वर्णन और आर्थिक रूप से महत्वपूर्ण परिग्रहणों की पहचान; उपन्यास यौगिकों का उत्पादन: फलारिस माइनर के लिए वानस्पतिक शाकनाशियों का अलगाव और लक्षण वर्णन। इस विद्यालय के अंतर्गत निम्नलिखित विभाग हैं: